王竞 Jing WANG 周雷 Lei ZHOU 邓麟 Lin DENG 蔡羽轩 Yu-Hsuan TSAI 吴炜祥 Goh, W.S. Sho 张浩岳 Adam ZHANG 梁卓斌 Zhuobin LIANG 龙海珍 Jenn LONG 张洋 Yang ZHANG 王子曦 Zixi WANG 罗佗平 Tuoping LUO 李毓龙 Yulong LI 曾健智 Jianzhi ZENG

  • 王竞 Jing WANG

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    王竞
       Jing WANG



    分子生理学研究所

    资深研究员、所长

    wangjing@szbl.ac.cn



    Timeline

    • 2025 至今                深圳湾实验室                                               分子生理学研究所  资深研究员、所长

    • 2004-2024              加州大学圣地亚哥分校                             神经生物学系  终身教授、系主任

    • 2000-2004              哥伦比亚大学                                               博士后         

    • 1997-2000              贝尔实验室                                                    博士后

    • 1991-1997              爱荷华大学                                                    博士

    • 1982-1990              清华大学                                                        学士、硕士

     


    研究领域
    王竞博士的研究专注于神经回路如何处理感官信息,聚焦于进化塑造的先天行为的神经调控机制。利用果蝇作为模型,借助其强大的遗传工具和简化的神经解剖结构,他的研究以工程学原理为框架,探索神经回路的感官信息处理方式和行为调控逻辑。



    研究成果

    反馈机制是控制理论的重要概念,在神经系统中广泛存在。正反馈提升灵敏度,而负反馈则增强稳定性、抑制过度反应。王竞博士的研究揭示了神经调节剂(如神经肽和激素)如何通过重塑神经回路使动物行为适应环境变化、代谢需求和生理状态。他的研究显示,饥饿状态通过正反馈增强吸引信号、负反馈抑制排斥信号,从而改变果蝇的嗅觉处理。此外,年龄与种群密度通过激素调控两性互动行为,这些研究对神经科学及相关领域提供了深远启示。
    王竞博士还在技术层面推动了神经科学的新突破。他率先将钙离子探针GCaMP用于体内细胞成像,开创了神经回路与行为研究的新纪元。他开发的基于NFAT的活性报告系统,被广泛用于标记和操控与行为相关的神经回路。此外,通过引入三光子显微镜技术并结合荧光蛋白与GCaMP,他首次实现了果蝇活体脑的非侵入式成像。
    近五年,王竞的研究重点转向肠脑轴的功能研究。他发现,肠道释放的神经肽不仅调控食欲,还能协调大脑中不同的回路模块。这些发现表明,肠道神经肽驱动果蝇在饥饿和饱食状态下对觅食和求偶行为进行优先级选择。这一研究为神经回路灵活性及操作逻辑的理解提供了全新视角。
    王竞博士多次担任NIHNSF等机构的同行评审专家,曾荣获塞尔学者奖和贝克曼青年研究员奖,在NatureCell等国际知名期刊发表了50多篇论文,他的研究受到了同行的高度评价和新闻媒体报道。




    荣誉

    贝克曼青年研究院奖
    塞尔学者奖



    代表论文
    1.Lin HH, Kuang MC, Hossain I, Xuan Y, Beebe L, Shepherd AK, Rolandi M,Wang JW.(2022) A nutrient-specific gut hormone arbitrates between courtship and feeding.Nature. 602(7898):632-638.
    2. Sethi S, Lin HH, Shepherd AK, Volkan PC, Su CY,Wang JW.(2019) Social Context Enhances Hormonal Modulation of Pheromone Detection in Drosophila.Current Biology. 29(22):3887-3898.
    3. Tao X, Lin HH, Lam T, Rodriguez R,Wang JW, Kubby J. (2017) Transcutical imaging with cellular and subcellular resolution.Biomedical Optics Express. 8(3):1277.
    4. Lin HH, Cao DS, Sethi S, Zeng Z, Chin JS, Chakraborty TS, Shepherd AK, Nguyen CA, Yew JY, Su CY,Wang JW.(2016) Hormonal Modulation of Pheromone Detection Enhances Male Courtship Success.Neuron. 90(6):1272-85.
    5. Ko, K.I., Root, C.M., Lindsay, S.A., Zaninovich, O.A., Shepherd, A.W., Wasserman, S.A., Kim, S.M.,Wang, J.W.(2015) Starvation Promotes Concerted Modulation of Appetitive Olfactory Behavior via Parallel Neuromodulatory Circuits.eLife. 4:e08298.
    6.Masuyama K, Zhang Y, Rao Y,Wang JW.(2012) Mapping neural circuits with activity-dependent nuclear import of a transcription factor.J. Neurogenetics.26: 89-102.
    7. Root C.M., Ko K.I., Jafari A., andWang J.W.(2011) Presynaptic facilitation by neuropeptide signaling mediates odor-driven food search.Cell.145: 133-44.
    8. Semmelhack J.L. andWang J.W.(2009) Select Drosophila glomeruli mediate innate olfactory attraction and aversion.Nature.459:218-23.
    9. Root C.M., Masuyama K., Green D.S., Enell L.E., Nässel D.R., Lee C.H.,Wang J.W.(2008) A presynaptic gain control mechanism fine-tunes olfactory behavior.Neuron.59:311-21.
    10.Wang, J.W., Wong, A.M., Flores, J., Vosshall, L.B., and Axel, R. (2003). Two-photon calcium imaging reveals an odor-evoked map of activity in the fly brain.Cell.112: 271-282.

  • 周雷 Lei ZHOU

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    周雷     Lei ZHOU





    分子生理学研究所

    资深研究员

    zhoulei@szbl.ac.cn

     


    Timeline

    • 2020 至今                  深圳湾实验室         资深研究员

    • 2008-2020                美国弗吉尼亚医学院         副教授

    • 2000-2008                美国哥伦比亚大学         博士后

    • 2000                         美国威斯康星大学 医学院生理系         博士

    • 1992-1994               中国医学科学院 肿瘤所核医学         硕士

    • 1992                         南开大学 物理系         学士

     



    研究方向

    1. 膜蛋白(主要为离子通道)分子生物物理机制;

    2. 离子通道相关的神经生理和心脏生理功能以及相关疾病;

    3. 与离子通道相关的蛋白质动力学计算,能量计算及药物设计。

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    膜片钳荧光测定法
                              与自闭症相关的 Shank3 蛋 白和 HCN 通道在神经元中 的功能

     
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    1O2 介导的对离子 通道的光化学修饰                                  蛋白质动力学及与相关能量计算

     


    成果

    1. 发展膜片钳荧光记录作为研究膜蛋白分子机制的一个有效工具;

    2. 研究 HCN 通道的 cAMP 门控机制,着重探索配体与蛋白受体的动态结合,首次报道人类 HCN 通道 cAMP 结合部的晶体结构;

    3. 建立研究单线态氧 1O2 修饰离子通道的分子模型并探索其生物物理机制和生理学意义;

    4. 研究 HCN 通道在正常和疾病状态的神经系统中尤其与自闭症相关的生理功能;

    5. 发展了一种粗粒度正态模式分析 (NMA) 方法并应用于解析蛋白质内部重要相互作用以及与蛋白表面水相关的蛋白动力学。

    在学术界公认的权威期刊上发表了 6 篇第一作者文章和14 篇通讯作者文章。作为唯一或主要课题负责人,获得了美国心脏学会,美国国立卫生研究院,以及美国国家超级计算中心的科研资助。

     


    荣誉

    • 第18届 Jerzy E. Rose 神经科学优秀研究生奖 ( 美国威斯康星大学麦迪逊分校,2000)

    • 沈寿春实验物理奖(南开大学物理系,1991)



    代表论文

    1. Zhang X, Wu R, Liu Q, Zhou L*.Interfacial water molecules contribute to antibody binding to the receptor-binding domain of SARS-CoV-2 spike protein.J Biomol Struct Dyn. 2023 Apr 12:1-10.

     2. Yao R, Hou J, Zhang X, Li Y, Lai J, Wu Q, Liu Q, Zhou L*.Targeted photodynamic neutralization of SARS-CoV-2 mediated by singlet oxygen.Photochem Photobiol Sci. 2023 Feb 8:1-18.

    3. Shah N, Zhou L*.Regulation of Ion Channel Function by Gas Molecules.Adv Exp Med Biol. 2021;1349:139-164. PMID: 35138614 Review.

    4Wei F, Wang Q, Han J, Goswamee P, Gupta A, McQuiston AR, Liu Q, Zhou L*.Photodynamic modification of native HCN channels expressed in thalamocortical neurons.ACS Chem Neurosci. 2020 Feb 20; 11(6):851-863.

    5Idikuda V, Gao W, Grant K, Su Z, Liu Q, and Zhou L*State-dependent binding of cAMP to closed, inactivated, and open sea urchin HCN channels.Journal of General Physiology. 2019 Feb 4;151(2):200-213. PMID: 30541772 Dec 12.

    6. Idikuda V, Gao W, Grant K, Su Z, Liu Q, and Zhou L* Singlet oxygen modification abolishes voltage-dependent inactivation in sea-urchin hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated (spHCN) channel. Journal of General Physiology. 2018 Sep 3;150(9):1273-1286.018.

    7. Zhu M, Idikuda V, Wang J, Wei F, Kumar V, Shah N, Waite CB, Liu Q, Zhou L*.Shank3-deficient thalamocortical neurons show HCN channelopathy and alterations in intrinsic electrical properties. Journal of Physiology. 2018 Apr 1;596(7):1259-1276.

    8. Liu C, Xie C, Grant KL, Su Z, Gao W, Liu Q, Zhou L*. Determine the unitary conductance of HCN channels by a channel counting method based on patch-clamp fluorometry Journal of General Physiology. 2016 Jul;148(1):65-76.

    9. Gao W, Su Z, Liu Q, Zhou L* State-dependent and site-directed photodynamic transformation of HCN2 channel by singlet oxygen. Journal of General Physiology. 2014 May;143(5):633-44.

    10. Zhou L*, Liu Q. Aligning experimental and theoretical anisotropic B-factors: water models, normal-mode analysis methods, and metrics. Journal of Physical Chemistry B. 2014 Apr 17;118(15):4069-79.

  • 邓麟 Lin DENG

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    邓麟
          Lin DENG




    分子生理学研究所

    特聘研究员

    denglin@szbl.ac.cn

    课题组主页:https://www.deng-lab.net/research




    Timeline

    • 2020 至今                  深圳湾实验室         特聘研究员

    • 2015-2020                哈佛医学院生化与分子药理系、细胞生物学系         博士后

    • 2015-2020                Dana-Farber癌症研所儿科肿瘤系、霍华德-休斯医学研究所博士后

    • 2010-2015                美国达特茅斯学院         生物化学博士

    • 2008-2010                西北农林科技大学         植物病理学硕士

    • 2004-2008                西北农林科技大学         生物技术学士

     


    研究方向

    细胞周期与基因组稳定性。课题组运用前沿的分子生物学、基因编辑以及活细胞高通量成像技术,结合体外生化重建、细胞和动物模型,研究在正常或病理条件下的细胞周期调控及其对基因组稳定性的影响,揭示癌症基因组进化过程中的信号转导途径,开发肿瘤治疗的新靶点、新药物和治疗新手段。

     


    成果

    首次在体外重建了有丝分裂早熟过程,阐明了细胞周期紊乱导致基因组不稳定的分子机理;揭示了细胞周期中 G2/M 转换以及细胞生长和分裂调控过程中的信号转导通路;发现并鉴定了一系列新的细胞周期调控因子和亚细胞结构。迄今,在Molecular Cell、Current Biology、Nature 等国际一流杂志发表论文二十余篇。

     


    荣誉

    • 2017 深圳市“鹏城国际青年之友”

    • 达特茅斯学院 Copenhaver - Thomas Fellow

    • 达特茅斯医学院 E. Lucile Smith Award

    • 中国优秀自费留学生奖学金


    媒体报道

     

    媒体聚焦 | 实验室快速引才聚才,源头创新动力十足

     



    代表论文

    1. Deng, L., Wu, R.A., Sonneville, R., Kochenova, O.V., Labib, K., Pellman, D., and Walter, J.C. (2019). Mitotic CDK promotes replisome disassembly, fork collapse, and complex DNA rearrangements. Molecular Cell, 73(5):915-929.e6. PMID: 30849395.

    2. Deng, L., Lee, M.E. Schutt K.L., and Moseley, J.B. (2017). Phosphatases generate signal specificity downstream of Ssp1 kinase in fission yeast. Molecular and Cellular Biology, 37:e00494-16.doi: 10.1128/MCB.00494-16. PMID: 28223368.
    3. Deng, L., Baldissard, S., Kettenbach, A.N., Gerber, S.A., and Moseley, J.B. (2014). Dueling kinases regulate cell size at division through the SAD kinase Cdr2. Current Biology 24, 428-433. PMID: 24508166.

    4. Deng, L., Kabeche, R., Wang, N., Wu, J.Q., and Moseley, J.B. (2014). Megadalton node assembly by binding of Skb1 to the membrane anchor Slf1. Molecular Biology of the Cell 25, 2660-2668. PMID: 25009287.

    5. Deng, L., and Moseley, J.B. (2013). Compartmentalized nodes control mitotic entry signaling in fission yeast. Molecular Biology of the Cell 24, 1872-1881. PMID: 23615447.

  • 蔡羽轩 Yu-Hsuan TSAI

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    蔡羽轩      Yu-Hsuan TSAI




    分子生理学研究所

    特聘研究员

    tsai@szbl.ac.cn

    课题组主页:https://tsai-lab.org/



    Timeline

    • 2020 至今                 深圳湾实验室         特聘研究员

    • 2015-2020               卡迪夫大学 化学系         独立课题组组长

    • 2012-2014               英国医学研究委员会 分子生物学实验室         博士后研究员

    • 2009-2012               柏林自由大学         博士

    • 2007-2008               苏黎世联邦理工学院         硕士

    • 2006-2007               中研院生化所         科研助理

    • 2003-2006               台湾大学         学士



    研究领域

    课题组致力于化学和生物医学交叉研究,通过开发新方法和新技术来解决生命科学领域的重要难题,为疾病诊断和治疗提供新工具和新思路。课题组具备化学生物学、化学合成、药物开发、基因编辑、基因密码子扩展技术等专长,专注于蛋白质活性调控的研究,并应用于癌症等疾病的诊断和治疗(包含小分子药物、生物制剂、基因疗法和细胞疗法)以及传染病的预防。

     

    成果

    蔡羽轩博士于高中二年级时保送台湾大学化学系,并在三年内修完全部课程提前毕业,同时获得理学院院长奖殊荣,也是当年度台湾大学最年轻的毕业生。之后在Peter Seeberger教授的指导下以一年的时间取得苏黎世联邦理工学院的硕士学位,并跟随Seeberger教授到马普所攻读博士学位,期间专精于糖类的鉴定、合成和生物医学应用,工作成果得到相关领域专家的正面评价,并获得一系列奖励。博士毕业之后,在英国医学研究委员会分子生物学实验室Jason Chin课题组从事交叉有机化学和分子生物学的研究,发展利用非天然氨基酸来解析特定蛋白质在细胞内的功能。2015年在英国卡迪夫大学担任建立独立课题组,主持和参与了总值超过240万英镑的研究项目。于2020年加入深圳湾实验室分子生理学研究所,现在同时也是PLOS ONE学术编辑、英国高等教育学会会士。

    蔡羽轩博士先后致力于糖类和蛋白质化学生物学的前沿性研究,取得了一系列创新性的优秀成果,论文发表于Chem. Soc. Rev.、Nat. Chem.、J. Am. Chem. Soc.、Angew. Chem. Int. Ed.、Chem. Sci. 等刊物(https://tsai-lab.org/publications/)。


    代表图片
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    荣誉

    • 2001,陶氏化学奖

    • 2001,中国化学学会奖

    • 2006,台湾大学理学院院长奖

    • 2007,苏黎世联邦理工学院奖学金

    • 2008,诺华硕士奖学金

    • 2009,德国学术交流中心奖学金

    • 2011,欧洲科学基金会奖学金

    • 2012,马普所博士奖学金

    • 2012,英国医学研究委员会职涯发展奖

    • 2013,欧洲分子生物学组织博士后奖学金

    • 2017,英国西南大学联盟人才培养计划

    • 2018,英国科学促进协会传媒青年学者奖

    • 2019,卡迪夫未来人才奖

     

     

     

    媒体报道

    1. Protein expression, revisited

    2. New Approach To Control Enzyme Function In Cells

    3. ACS Publications

     

     

    代表论文 

    1. Y.-H. Tsai*, T. Doura, S. Kiyonaka, Tethering-based chemogenetic approaches for the modulation of protein function in live cells. Chem. Soc. Rev. 2021, 50, 7909.

    2. A. R. Nödling, E. M. Mills, X. Li, D. Cardella, E. J. Sayers, S.-H. Wu, A. T. Jones, L. Y. P. Luk, Y.-H. Tsai*, Cyanine dye mediated mitochondrial targeting enhances the anti-cancer activity of small-molecule cargoes. Chem. Commun. 202056, 4672.

    3. J.-H. Liao, C.-H. Tsai, S. G. Patel, J.-T. Yang, I-F. Tu, M. Lo Cicero, M. Lipka-Lloyd, W.-L. Wu, W.-J. Shen, M.-R. Ho, C.-C. Chou, G. R. Sharma, H. Okanishi, L. Y. P. Luk, Y.-H. Tsai*, S.-H. Wu*, Acetylome of Acinetobacter baumannii SK17 reveals a highly-conserved modification of histone-like protein HU. Front. Mol. Biosci. 20174, 77.

    4. Y. -H. Tsai, S. Essig, J. R. James, K. Lang, J. W. Chin*, Selective, rapid and optically switchable regulation of protein function in live mammalian cells. Nat. Chem. 20157, 554.

    5. X. Zheng, Z. Li, W. Gao, X. Meng, X. Li, L. Y. P. Luk, Y. Zhao, Y.-H. Tsai*, C. Wu*, Condensation of 2-((alkylthio)(aryl)methylene)malononitrile with 1,2-aminothiol as a novel bioorthogonal reaction for site-specific protein modification and peptide cyclization. J. Am. Chem. Soc. 2020142, 5097.

  • 吴炜祥 Goh, W.S. Sho

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    吴炜祥      Goh, W.S. Sho



    分子生理学研究所

    特聘研究员

    shogoh@szbl.ac.cn

    课题组主页:https://gohlab.org/






    Timeline

    • 2020-Present                Shenzhen Bay Laboratory         Junior Principal Investigator

    • 2018-2020                    Genome Institute of Singapore         Junior Principal Investigator

    • 2015-2017                    Institute of Molecular and Cell Biology         Post-doctoral Fellow

    • 2009-2015                    Cold Spring Harbor Laboratory, USA         Ph.D. in Biological Science

    • 2008-2009                    Genome Institute of Singapore         Bioinformatics Research Officer

    • 2005-2008                    University of Pennsylvania, USA         B.S.E. (Summa Cum Laude) in Bioengineering



    Research Areas 

    The Goh lab studies how RNA modifications (epitranscriptome) regulate gene expression and cellular processes by developing new technologies to sequence RNA modifications and functionally characterizing novel epitranscriptomic factors that interact with and metabolize RNA modifications. Defects in epitranscriptomic regulation cause a variety of diseases and determining the mechanistic basis that underlie these defects will be crucial for developing effective epitranscriptomic-based therapeutic strategies.
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    Achievements

    In recent years, Sho has focused on the study of RNA modifications, also known as Epitranscriptomics. One of his key contributions to this field is the development of high-resolution epitranscriptome sequencing technologies. These technological advancements helped facilitate the discovery of novel epitranscriptomic factors that generate RNA modifications, which revealed new mechanisms by which modified RNA is regulated. Sho has also challenged popularly held notions of epitranscriptomic pathways by using precise sequencing methods to accurately identify the metabolic targets of previously known epitranscriptomic factors and thus, redefined their functional roles. As a member of the RNA society since 2020, Sho's work has been published in prestigious journals (including Nature Communications, Nucleic Acids Research, Genes & Development, PLoS Computational Biology and Cell ) and resulted in a patent and multiple research grants.

     

    Honors

    • Career Development Award (Singapore)

     

    • Young Investigator Grant (Singapore)

     

    • Global Young Scientists Summit Award (Singapore) 

     

    • McClintock Fellow (Cold Spring Harbor Laboratory)

     

    • National Science Scholarship for Ph.D. (Singapore)

     


    Current Openings 

    1. Associate Research Fellow / Assistant Research Fellow

    2. Postdoc

    3. Research Assistant

     


    Media Coverage

    人物 | Singaporean scientist at SZ Bay lab 新加坡科学家为你揭秘RNA修饰

     

    Selected Publications

    1. Pratanwanich PN*, Yao F, Chen Y, Koh CWQ, Hendra C, Poon P, Goh YT, Yap PML, Yuan CJ, Chng WJ, Ng SB, Thiery A, Goh WSS*, Göke J*. Detection of differential RNA modifications from direct RNA sequencing of human cell lines (2020) Biorxiv.

    2. Goh YT, Koh CWQ, Sim DY, Roca X*, Goh WSS*. METTL4 catalyzes N6-methylation of adenosines in U2 snRNA to regulate pre-mRNA splicing (2020) Nucleic Acids Research.

    3. Koh CWQ, Goh YT, Goh WSS*. Atlas of quantitative single-base-resolution N6-methyl-adenine methylomes (2019) Nature Communications.

    4. Koh CWQ, Goh YT, Toh JDW, Neo SP, Ng SB, Gunaratne J, Gao YG, Quake SR, Burkholder WF, Goh WSS*. Single-Nucleotide-Resolution Sequencing of Human N6-Methyldeoxyadenosine Reveals Strand-Asymmetric Clusters Associated with SSBP1 on the Mitochondrial Genome (2018) Nucleic Acids Research (Highlighted in NAR Breakthrough Article).

    5. Goh WSS, Falciatori I, Tam OH, Burgess R, Meikar O, Kotaja N, Hammell M, Hannon GJ*. piRNA-Directed Cleavage of Meiotic Transcripts Regulates Spermatogenesis (2015) Genes & Development.

  • 张浩岳 Adam ZHANG

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    张浩岳      Adam ZHANG




    分子生理学研究所

    特聘研究员

    zhang_adam@szbl.ac.cn



    Timeline

    • 2021 至今               深圳湾实验室         特聘研究员

    • 2016-2021             美国费城儿童医院         博士后

    • 2011-2016             美国马里兰大学帕克分校         博士

    • 2007-2011             同济大学         学士

     

    研究方向

    表观遗传学,基因组学,3D基因组学,转录调控与疾病,有丝分裂,衰老



     

    成果

    · 建立了早老症(HGPS)病人血管平滑肌细胞的体外诱导分化系统。

    · 首次阐明了早老症病人血管平滑肌细胞死亡的分子机制,为早衰症治疗提供了新思路。

    · 首次阐明了动物细胞染色质在有丝分裂之后子细胞当中的重塑过程,解析了染色质结构蛋白CTCF以及cohesin环复合体在有丝分裂后与染色质重新结合的动力学特征。为环挤压模型(loop extrusion model)在有丝分裂后染色质三维结构的重塑的调控作用提供了有力证据。

    · 阐释了有丝分裂后染色质结构重塑与基因转录重启之间的关系。

    · 阐明了染色质结构蛋白CTCF在有丝分裂后染色质结构重塑中的作用

     

    成果发表论文十余篇,并以第一作者身份在Nature, PNAS, Aging Cell 等杂志发表文章。并以共同作者身份在Nature Genetics, Genome Research, Cell Reports, Scientific Reports 等杂志发表文章。 

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                                                          有丝分裂后A/B蛋白质区域(分段)重塑过程



    荣誉

    • 2017 Charles A. Caramello Distinguished Dissertation Award, University of Maryland College Park

    • 2014 MOCB Travel Award, University of Maryland College Park

    • 2014 BISI Merit Student Award, University of Maryland College Park

    • 2013 Best Poster Presentation Award. University of Maryland, School of Medicine

    • 2011 Dean' s Fellowship, University of Maryland College Park

    • 2011 Best Thesis Award, Tongji University

    • 2010 China National Scholarship, Ministry of Education, China

    • 2009 First Class Scholarship, Tongji University

    • 2009 Shanghai Scholarship, Shanghai Education Commission, China 

     




    代表论文

    1. Zhang, H., Emerson, D. J., Gilgenast, T. G., Titus, K. R., Lan, Y., Huang, P., ... Blobel, G. A. (2019). Chromatin Structure Dynamics During the Mitosis-to-G1 Phase Transition. Nature, 576(7785), 158-162. | DOI:10.1038/s41586-019-1778-y

    2. Zhang H and Cao K (2016). Mechanisms of Genome Instability in Hutchinson-Gilford Progeria. Frontiers in Biology, DOI 10.1007/s11515-016-1435-x

    3. Zhang H, Sun L, Wang K, Wu D, Trappio M, Witting C and Cao K (2016). Loss of H3K9me3 Correlates with ATM Activation and Histone H2AX Phosphorylation Deficiencies in Hutchinson-Gilford Progeria Syndrome. Plos ONE, 11(12) e0167454. doi: 10.1371/journal. pone.0167454. PMID: 27907109

    4. Zhang H, Xiong Z and Cao K (2014). Mechanisms Controlling the Smooth Muscle Cell Death in Progeria via Down-Regulation of poly(ADP-ribose) Polymerase 1. PNAS, 111(2) 2261-2270.

    5. Zhang H, Keickhaefer JE and Cao K. (2013) Mouse Models of Laminopathies. Aging Cell, 12(1) 2-10.

     


  • 梁卓斌 Zhuobin LIANG

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    梁卓斌      Zhuobin LIANG



    分子生理学研究所

    特聘研究员

    zbliang@szbl.ac.cn




    Timeline

    • 2021至今                深圳湾实验室         特聘研究员

    • 2017-2021             美国耶鲁大学         博士后

    • 2015-2017             美国耶鲁大学医学院         博士后

    • 2009-2015             美国密西根大学         分子生物学博士

    • 2004-2008             上海交通大学         植物生物技术学士

     

    研究领域

    课题组主要从事基因组不稳定性机理研究及新型基因组编辑工程技术开发,同时运用前沿合成生物学手段以阐明人体疾病、衰老机理、发现新颖天然药物及靶点、以及研发基于基因、免疫和干细胞治疗等精准医学疗法。课题组具有很强的学科交叉背景,开展课题广泛涉及分子细胞生物学、遗传学、生物化学、系统生物学、合成生物学、生物信息、生物技术、血液免疫学、生物医学工程、病毒学等学科。实验室能灵活运用多种生物学模型,涵盖病原微生物、病毒、植物、酵母、哺乳动物细胞系、小动物模型以及体外无细胞体系等。实验室将开展从基础医学研究到精准医学技术开发,再到临床转化应用的一系列工作。



    主要研究方向:

    1)新一代基因组编辑工程技术开发与精准医学应用

    2)基因组不稳定性在癌症及衰老等疾病中的致病分子机理

    3)高效天然药物发现及生物合成创新技术平台

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                                                 注解:梁卓斌课题组将开展多研究领域的交叉融合以促进精准生物医药基础研究与临床转化应用

     

     

    成果

    课题组PI在旅美期间先后以PI或Co-PI身份主持参与了总值约100万美金的多个研究项目,发表高水平论文十余篇。以第一作者或共同通讯作者论文发表在Nature Communications, Nucleic Acid Research, Cell Report, Plant Physiology 等杂志;以共同作者身份在Nature Biotechnology, ACS Central Science, Nature Communicates, PLOS Genetics, Journal of Biochemistry 等杂志发表多篇论文。主要成果如下:

    1. 揭示了转基因植物遗传转化过程中宿主DNA修复途径参与农杆菌单链T-DNA双链化过程的新机理。

    2. 成功开发出可用于多基因天然药物生物合成的新型技术平台,并实现世界上首次抗疟疾药物青蒿素在转基因烟草中的全生物合成。

    3. 阐明基因编辑工具Zinc Finger Nuclease(ZFN)产生的5’端突出DNA双链断裂(DSB)末端结构影响突变产生的分子遗传学机理,对类似基因编辑工具开发应用及阐明DSB非同源末端连接(NHEJ)修复缺陷的致病机理产生积极意义。

    4. 发现范可尼贫血症(Fanconi Anemia)相关的DNA链间交联(ICL)修复蛋白复合体FANCI-FANCD2可通过结合多种RNA底物产生特异位点泛素化修饰,揭示了其参与修复RNA转录引起的基因组不稳定性在相关血液疾病的新机理。

    5. 大幅改良新型真核细胞基因组编辑工具eMAGE的编辑效率和编辑精度,并应用于人类乳癌等癌症相关受体蛋白致病突变的研究。

    6. 开发出一系列可用于快速构建并安全检测新型冠状病毒(SARS-CoV-2)泛基因组突变的基因组工具,有望被广泛应用于新冠COVID-19致病机理研究、治疗药物筛选以及针对病毒变异的疫苗研发。

     

    荣誉

    • 2003 国家一级运动员(国际象棋)

    • 2005 上海交通大学最高A等奖学金

    • 2007 上海交大优秀学生干部(曾任学院学生会主席、学生科创中心主任)

    • 2008 上海市奖学金

    • 2008 上海市优秀毕业生

    • 2015 美国密西根大学校长Coleman奖学金

    • 2015 美国密西根大学博士论文奖金

    • 2016 Damon Runyon博士后奖金

    • 2018 耶鲁癌症中心创新奖

    • 2020 耶鲁大学新冠病毒先导研究奖励

     

     

     

    媒体报道

    1. UMich Student Spotlight 

    2. Damon Runyon Cancer Research Foundation 

    3. Awarded NSF-EDGE funding to develop cutting-edge genomics tools – as Co-PI in the Isaacs laboratory

    4. Yale COVID-19 Pilot Projects – as Co-PI in the Isaacs laboratory

     

    代表论文

    1. Liang Z.*, Metzner E. and Isaacs F.J.* (2020). “Advanced eMAGE for highly efficient combinatorial editing of a stable genome.” bioRxiv doi.org/10.1101/2020.08.30.256743 (Nat Commun, in revision) IF=12.1

    2. Liang Z., Liang F., Teng Y., Chen X., Liu J., Longerich S., Rao T., Green A. M., Collins N. B., Xiong Y., Lan L., Sung P. and Kupfer G. M. (2019). “Binding of FANCI-FANCD2 complex to RNA and R-Loops stimulates robust FANCD2 monoubiquitination.” Cell Rep IF=8.1

    3. Liang Z., Sunder S., Nallasivam S. and Wilson T. E. (2016). “Overhang polarity of chromosomal double-strand breaks impacts kinetics and fidelity of yeast non-homologous end joining.” Nucleic Acids Res 44(6): 2769-2781. IF=11.5

    4. Liang Z. and Tzfira T. (2013). “In vivo formation of double-stranded T-DNA molecules by T-strand priming.” Nat Commun 4: 2253. IF=12.1

    5. Liang Z.*, Chiruvella K. K.*, and Wilson T. E. (2013). “Repair of double-strand breaks by end joining.” Cold Spring Harb Perspect Biol 5(5): a012757 – Chapter XVI of the Book: DNA Repair, Mutagenesis, and Other Responses to DNA Damage. (*co-first author)

     

     

    个人主页https://scholar.google.com/citations?user=DVIPilkAAAAJ&hl=en

     


  • 龙海珍 Jenn LONG

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    龙海珍       Jenn LONG



    分子生理学研究所

    特聘研究员

    longhaizhen@szbl.ac.cn

     


    Timeline

    • 2022 至今              深圳湾实验室         特聘研究员

    • 2020-2022            中国科学院生物物理研究所         副研究员

    • 2018-2020            中国科学院生物物理研究所         助理研究员

    • 2016-2018            中国科学院生物物理研究所         博士后

    • 2010-2016            中国科学院大学生物物理研究所         博士

    • 2006-2010            湖南师范大学         学士

     

    研究领域

    DNA复制是遗传信息精确传递的基础,受到遗传因素和表观遗传因素的共同调控。在基因组中,DNA复制是从某些特殊的区域开始的,该区域被称为“复制起始位点”。正确的DNA复制起始是生理状态下细胞进行生长分裂和发挥生理功能的基础,但是,在位置或时间上发生错误的DNA复制起始都可能会导致DNA序列的突变以及基因组不稳定性,甚至遗传信息的错误传递,从而促进癌症的产生以及遗传疾病的发生。
    基于此,本课题组的研究方向是DNA复制的表观遗传调控机制及其在肿瘤发生发展和细胞分化发育过程的作用。 

     


    成果

    龙海珍研究员主要围绕表观遗传因子在复制和转录过程中的生物学功能进行了一系列研究,研究成果发表在Nature、Nature Structural & Molecular Biology、BMC Biology以及Genes & Development、Genome Biology 等杂志上。研究成果荣获2020年度中国科学十大进展(进展四:揭示人类遗传物质传递的关键步骤),并入选科技部“十三五”代表性成果展。还获得了深圳市优青、中国科协青年人才托举工程,科技部国家重点研发计划,国自然青年基金,中科院青年创新促进会等项目的支持。

    主要成果如下:

    (1)多细胞真核生物中,DNA复制起始位点的识别机制仍不清楚,课题组PI的研究工作揭示了一个新颖的由组蛋白变体H2A.Z介导的DNA复制表观遗传调控通路——H2A.Z-SUV420H1-H4K20me2-ORC1,相关成果发表在Nature杂志,获F1000 prime推荐,并荣获2020年度中国科学十大进展(进展四:解释人类遗传物质传递的关键步骤),以及国家“十三五”科技创新成就展。同时课题组PI与结构生物学、化学等方向专家合作,进一步探究了该通路的转化应用前景。

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         组蛋白变体H2A.Z在DNA复制起始位点选择和激活中的作用

    2)研究发现组蛋白 H4S47 的O-GlcNAc 修饰能通过促进蛋白激酶 DDK 在染色质上的招募,帮助解旋酶 MCM 复合物完成激活,进而开启 DNA 的复制。该研究将DNA复制与细胞代谢也联系起来,为深刻理解细胞如何在动态变化的营养环境下保障遗传物质的正确传递开启了新的视角。相关研究成果发表在Nature Structural & Molecular Biology杂志。

    3)复制、转录、翻译是中心法则的核心内容。课题组PI研究了表观遗传在基因转录调控中的作用,并发现组蛋白变体H2A.Z和H3.3能够协同调控染色质高级结构的动态变化,从而调控基因转录,并进一步参与了免疫等重要生理过程。



    荣誉

    • 2023 深圳市优秀科技创新人才培养项目(优青项目)

    • 2022 入选中国科协生命科学学会联合体第七届“青年人才托举工程”项目

    • 2020 中国科学院青年创新促进会会员

     

    媒体报道

    刚刚,2020年度中国科学十大进展公布!


    代表论文:

    (1) Haizhen Long#; Liwei Zhang#; Mengjie Lv#; Zengqi wen#; Wenhao Zhang; Xiulan Chen; Peitao Zhang; Tongqing Li; Luyuan Chang; Caiwei Jin; Guozhao Wu; Xi Wang; Fuquan Yang; Jianfeng Pei; Ping Chen; Raphael Margueron; Haiteng Deng; Mingzhao Zhu*; Guohong Li*; H2A.Z facilitates licensing and activation of early replication origins, Nature, 2020, 577(7791):576-581

    (2) Li Huang#; Youwang Wang#; Haizhen Long#*; Haoqiang Zhu; Zengqi Wen; Liwei Zhang; Wenhao Zhang; Zhenqian Guo; Longge Wang; Fangyi Tang; Jie Hu; Keyan Bao; Ping Zhu*; Guohong Li*; Zheng Zhou*; Structural insight into H4K20 methylation on H2A.Z-nucleosome by SUV420H1, Molecular Cell, 2023, 83(16): 2884-2895

    (3) Yingying Zou#; Jiayao Pei#; Haizhen Long#; Liting Lan; Kejian Dong; Tingting Wang; Ming Li; Zhexuan Zhao; Lirun Zhu; Gangxuan Zhang; Xin Jin; Yang Wang; Zengqi Wen; Min Wei; Yunpeng Feng*; H4S47 O-GlcNAcylation regulates the activation of mammalian replication origins, Nature Structural & Molecular Biology, 2023 Jun;30(6):800-811.

    (3) Yan Wang#; Haizhen Long#; Juan yu#; Liping Dong#; Michel Wassef; Baowen Zhuo; Xia Li; Jicheng Zhao; Min Wang; Cuifang Liu; Zengqi Wen; Luyuan Chang; Ping Chen; Qian-fei Wang; Xueqing Xu; Raphael Margueron*; Guohong Li*; Histone variants H2A.Z and H3.3 coordinately regulate PRC2-dependent H3K27me3 deposition and gene expression regulation in mES cells, BMC Biology, 2018, 16(107).

    (4) Liuxin Shi; Li Huang; Haizhen Long; Aoqun Song; Zheng zhou*; Structural basis of nucleosomal H4K20 methylation by methyltransferase SET8, FASEB 2022 Jun;36(6)

    (5) Ping Chen#, Jicheng Zhao#, Yan Wang#, Min Wang, Haizhen Long, Dan Liang, Li Huang, Zengqi Wen, Wei Li, Xia Li, Hongli Feng, Haiyong Zhao, Ping Zhu, Ming Li, Qian-fei Wang, Guohong Li (2013). "H3.3 actively marks enhancers and primes gene transcription via opening higher-ordered chromatin." Genes Dev. 27, 2109-2124 (2013)

    (6) Yongzheng Li#, Boxin Xue#, Mengling Zhang#, Liwei Zhang, Yingping Hou, Yizhi Qin, Haizhen Long, Qian Peter Su, Yao Wang, Xiaodong Guan, Yanyan Jin, Yuan Cao, Guohong Li, Yujie Sun, “Transcription-coupled structural dynamics of topologically associating domains regulate replication origin efficiency”, Genome Biol.2021;22:206

  • 张洋 Yang ZHANG

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    张洋      Yang ZHANG





    分子生理学研究所

    特聘研究员

    zhangyang@szbl.ac.cn

    课题组主页:http://zhanglab.szbl.ac.c



    Timeline

    • 2022 至今                深圳湾实验室         特聘研究员

    • 2020 – 2022            杜克大学生物化学系         资深博士后

    • 2015 – 2020            杜克大学生物化学系         博士后

    • 2014 – 2015            中科院深圳先进技术研究院         助理研究员

    • 2009– 2014             华中科技大学 生物医学工程专业         博士

    • 2005 – 2009            华中科技大学 生物医学工程专业         学士

     

    研究领域

    离子、磷脂的跨膜转运。课题组运用多种分子学方法,结合电生理、光学成像等技术手段,研究离子通道与磷脂翻转酶在生理与病理中的功能,为治疗发育异常、凝血功能障碍、病毒感染等相关疾病提供治疗方法。

     

     

    成果

    1. 理解TMEM16钙调离子通道与钙调磷脂翻转酶的生理功能

    a) 发现新型钙调氯离子通道在运动学习中的功能; b) 发现调控细胞融合的新机制; c) 揭示生理与病理条件下钙信号的调控。

    2. 发展用于理解离子、磷脂转运体的生理、病理功能的新技术、新方法

    a) 发展用于神经-胶质-血管在体三维可视化的光学新方法;b) 发明用于模式动物脑功能的无损监测技术

    发表论文18篇,其中以第一作者在Neuron, Science Advances, eLife, IEEE Transactions on Medical imaging 等期刊发表论文8篇,在Cancer Discovery, PNAS, Nature Communications, Journal of Biological Chemistry 等期刊合作发表论文10篇。授权发明专利四项。
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    荣誉

    • 2022年 Gordon Research Conference Best Poster Presentation Award

    • 2022年 Duke Biochemistry Retreat Poster Award

    • 2019年 Layton Holladay Memorial Fund基金会奖

    • 2017年 Burroughs Wellcome Fund合作研究奖

    • 2016年 Joy Cappel 青年科学家奖

     

    代表论文

    1. A.J. Lowry, P. Liang, M. Song, Y. Wan, Z. Pei, H. Yang,Y. Zhang(2024) TMEM16 and OSCA/TMEM63 proteins share a conserved potential to permeate ions and phospholipids eLife 13:RP96957 https://doi.org/10.7554/eLife.96957.3

    2. P. Liang1,Y. Zhang1, Y.S. Wan, S. Ma, P. Dong, A.J. Lowry, S.J. Francis, S. Khandelwal, M. Delahunty, M.J. Telen, J.J. Strouse, G.M. Arepally, H. Yang, Deciphering and Disrupting PIEZO1-TMEM16F Interplay in Hereditary Xerocytosis, Blood 143(4):357-69 (2024)

    3. Y. Zhang, P. Liang, L. Yang K. Shan, L. Feng, Y. Chen, W. Liedtke, C. B. Coyne, H. Yang, Functional coupling between TRPV4 channel and TMEM16F modulates human trophoblast fusion. eLife 11: e78840 (2022)

    4. Y. Zhang, T. Le, R. Grabau, Z. Mohseni, H. Kim, D. R. Natale, L. Feng, H. Pan, H. Yang, TMEM16F phospholipid scramblase mediates trophoblast fusion and placental development. Science Advances 6, eaba0310, 2020

    5. Y. Zhang, Z. Zhang, S. Xiao, J. Tien, S. Le, T. Le, L. Y. Jan, H. Yang, Inferior olivary TMEM16B mediates cerebellar motor learning, Neuron, 95:1103–1111, 2017

    6. X. Yang#Y. Zhang#, K. Zhao, Y. Zhao, Y. Liu, H. Gong, Q. Luo, and D. Zhu, Skull Optical Clearing Solution for Enhancing Ultrasonic and Photoacoustic Imaging., IEEE Transactions on Medical imaging, 35(8):1903-6, 2016

    7. C. Liao, Y. Zhang, C. Fan, L. E. Herring, J. Liu, J. W. Locasale, G. Zurlo, L. Hu, J. M. Simon, T. S. Ptacek, O. Pugovics, E. Loza, H. Yang, C. M. Perou, and Q. Zhang, Identification of BBOX1 as a therapeutic target in triple-negative breast cancer, Cancer Discovery 10(11): 1706-1721, 2020

    8. P. Dong, Y. Zhang, M. A. Mikati, J. Cui, H. Yang, Neuronal mechanism of a BK channelopathy in absence epilepsy and dyskinesia. PNAS 119 (12) e2200140119, 2022

    9. Y. Zhang, H. Yang, A simple and robust fluorescent labeling method to quantify trophoblast fusion, Placenta, 77:16-18, 2019

    10. Y. Zhang, C. Zhang, X. Zhong, D. ZhuQuantitative evaluation of SOCS-induced optical clearing efficiency of skull, Quantitative Imaging in Medicine and Surgery, 5(1), 136-142, 2015

    11. Y. Zhang, Y. Chen, Y. Yu, X. Xue, V. V. Tuchin, and D. Zhu, Visible and near-infrared spectroscopy for distinguishing malignant tumor tissue from benign tumor and normal breast tissues in vitro, Journal of Biomedical Optics 18(7), 077003, 2013

    12. J. Wang#Y. Zhang#, T. Xu, Q. Luo, and D. Zhu, An innovative transparent cranial window based on skull optical clearing, Laser Physics Letters 9(6), 469-473, 2012

     

  • 王子曦 Zixi WANG

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    王子曦
       Zixi WANG

     


    分子生理学研究所

    特聘研究员

    wangzixi@szbl.ac.cn

     

     

    Timeline

    • 2023 至今                深圳湾实验室 分子生理学研究所          特聘研究员

    • 2016-2023              美国德州大学西南医学中心        博士后/教师

    • 2013-2016              北京大学          博士后         

    • 2007-2013              北京大学          博士

    • 2003-2007              河北大学          学士

     


    招聘信息

    招聘博士生,助研,博士后

    https://mp.weixin.qq.com/s/13PMtr0Jj2TtJ-al4kUJfQ



    研究领域

    课题组的研究包括脂肪肝和肝癌的治疗,肝脏再生机理和应用,以及肝脏相关的基础生物学问题。方向包括但不局限于:

    1. 脂肪肝治疗新靶点的研发;

    2. 肝硬化和肝癌的缓解和治疗;

    3. 肝脏再生的分子基础;

    4.  肝脏的区块化代谢机理;

    5.  肝脏非实质细胞在脂肪肝发生和发展中的作用;

     

     

     

    成果

    深度测序的广泛应用发现正常组织存在许多体细胞突变。在硬化但并未癌变的肝脏样本同样观察到大量体细胞突变。它们与癌症组织来源的突变相比差异,且没有明显的致癌性。在器官水平上,这些体系胞突变并不表现出明显的表型。但在细胞水平上,携带某些突变的细胞会形成大小不一的克隆,说明突变影响了细胞的健康状态,使胞在特定微环境下比野生型更具有生存优势。目前并不清楚这些突变如何使细胞对环境更具适应性。我们的研究发现:抑制脂肪积累的突变使肝细胞更易增殖,而导致脂肪过度积累的突变使肝细胞更易消。我们开发了名为MOSAICS的体内筛选平台。该平台能够在肝脏中引入大量突变,并追踪突变细胞的丰度。我们发现Irs1Dgat2,Bcl6,Tbx3,Smyd2等基因的突变抑制了脂肪积累,在筛选中得到正向选择,并使携带这些突变的细胞在脂肪肝微环境下发生适应性增殖。其中,Tbx3Smyd2基因是筛选得到的全新的脂代谢调控基因 ,抑制它们的功能后大大减弱了脂肪肝的发生(Wang,et al. Cell, 2023。见Lan, et al. Signal Transduction and Targeted Therapy. 2023对文章的专门评述)。我们以期在后续的工作中发现更多新颖的脂代谢调控基因。

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    对于肝癌中反复存在的致癌突变,我们期待寻找特异的方法来杀伤携带特定突变的癌细胞。“合成致死”效应是其中一种治疗策略。其原理是,在一个基因失活的基础上合并了另外一个基因的失活后,细胞致死。对于携带高频ARID1A突变的癌细胞,之前的体外研究发现ARID1B是其合成致死基因。为了在动物模型上验证这一广泛接受的结论,我们构建了肝脏ARID1A/ARID1B双突变的小鼠模型,证明动物水平上双突变具有强烈的致癌性,表明 “合成致死”效应在不同条件下产生不同结果,提示合成致死治疗策略需要在动物水平上充分评估的重要性(Wang,et al. Nature Cancer, 2020)。针对不同的致癌突变,我们期待着后续的工作中找到更多针对性的治疗策略。

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    荣誉

    • 2022 CRI年度方法学进展奖,UTSW

    • 2013, 2015 北大-清华生命科学联合中心奖学金

    • 2004, 2005, 2006 河北大学优秀学生奖学金

     

     

    媒体报道

    •  2023 BioArt,https://mp.weixin.qq.com/s/C4RCWA3dJqP-iMVSEMMX2g

    •  2020 UTSW,https://www.utsouthwestern.edu/newsroom/articles/year-2020/dna-mutations-cancer.html

    •  2020 BioArt,https://mp.weixin.qq.com/s/JYGCEL2qa17UQP_GcIqmXw


    代表论文

    1.Wang, Z., Zhu, S., Jia, Y., Wang, Y., Kubota, N., Fujiwara, N., Gordillo, R., Lewis, C., Zhu, M., Sharma, T., Li, L., Zeng, Q., Lin, Y.H., Hsieh, M.H., Gopal, P., Wang, T., Hoare, M., Campbell, P., Hoshida, Y., Zhu, H. Positive selection of somatically mutated clones identifies adaptive pathways in metabolic liver disease. Cell. 186, 1968-1984, (2023)(Highlighted by Lan, et al. Signal Transduction and Targeted Therapy. 2023)

    2.Wang, Z. and Zhu, H. Exploiting liver metabolism for tissue-specific cancer targeting. Nature Cancer. 4, 310-311, (2023) (News & Views)

    3.Wang, Z., Chen, K., Jia, Y., Chuang, J-C., Sun, X., Lin, Y-H., Celen, C., Li, L., Huang, F., Liu, X., Castrillon, D.H., Wang, T., Zhu, H. Dual ARID1A/ARID1B loss leads to rapid carcinogenesis and disruptive redistribution of BAF complexes. Nature Cancer. 1, 909–922, (2020)

    4.Wei, Y., Wang, Y. G., Jia, Y., Li, L., Yoon, J., Zhang, S., Wang, Z., Zhang, Y., Zhu, M., Sharma, T., Lin, Y. H., Hsieh, M. H., Albrecht, J. H., Le, P. T., Rosen, C. J., Wang, T., and Zhu, H. Liver homeostasis is maintained by midlobular zone 2 hepatocytes. Science. 371 (2021)

    5.Huang, F., Huffman, K., Wang, Z., Wang, X., Li, K., Cai, F., Yang, C., Cai, L., Shih, T. S., Zacharias, L. G., Chung, A. S., Yang, Q., Chalishazar, M. D., Ireland, A. S., Stewart, C. A., Cargill, K. R., Girard, L., Liu, Y., Ni, M., Xu, J., Wu, X., Zhu, H., Drapkin, B. J., Byers, L. A., Oliver, T. G., Gazdar, A., Minna, J., and DeBerardinis, R. Guanosine triphosphate links MYC-dependent metabolic and ribosome programs in small cell lung cancer. JCI. 131, 1-18, (2021)

    6.Wang, Z., Liu, Y., Huang, S., and Fang, M. TRAF6 interacts with and ubiquitinates PIK3CA to enhance PI3K activation. FEBS Letters. 592, 1882-1892, (2018) (Co-correspondence)

    7.Wang, Z., Dang, T., Liu, T., Chen, S., Li, L., Huang, S., and Fang, M. NEDD4L Protein Catalyzes Ubiquitination of PIK3CA Protein and Regulates PI3K-AKT Signaling. JBC. 291, 17467-17477, (2016)

     

    See Google Scholar for full list:

    https://scholar.google.com/citations?hl=en&user=UeRzONAAAAAJ&view_op=list_works&sortby=pubdate

     

    专利

    1.Hao Zhu, Zixi Wang, Lin Li. Compositions and methods for treating liver diseases with siRNAs targeting Tbx3. Provisional Patent Application Serial No. 63/328,549; Polsinelli Matter No.: 106546-712251.

    2.Hao Zhu, Zixi Wang, Lin Li. Compositions and methods for treating liver diseases with siRNAs targeting Smyd2. Provisional Patent Application Serial No. 63/382,920; Polsinelli Ref. No.: 106546-743413.

    3.Hao Zhu, Zixi Wang, Lin Li. Compositions and methods for treating liver diseases with siRNAs targeting Gpam. Provisional Patent Application Serial No. 63/328,593; Polsinelli Matter No.: 106546- 735990.

    4.Hao Zhu, Zixi Wang, Lin Li. Compositions and methods for treating liver diseases with siRNAs targeting Cideb. Provisional Patent Application Serial No. 63/328,557; Polsinelli Matter No.: 106546-712249.


  • 罗佗平 Tuoping LUO

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    罗佗平      Tuoping LUO



    分子生理学研究所

    合作研究员

    luotp@szbl.ac.cn

     


    Timeline

    • 2019 至今             深圳湾实验室         合作研究员

    • 2013 至今            北京大学化学学院,北京-清华生命科学联合中心         研究员、博士生导师

    • 2011-2013          美国 H3 Biomedicine Inc.         博士后

    • 2005-2011          哈佛大学 化学与化学生物学系         博士2001-2005      北京大学 化学学院         学士

     

    研究方向

    围绕有高选择性和精确调控生物功能的有机小分子开展研究,包括:1)发展高效的方法合成和利用具有独特活性的天然产物,2)阐明小分子的作用机制,3)构建高时空分辨率的化学遗传学系统调控关键的药物靶标蛋白,4)设计并开发新的试剂和反应,在生理条件下对生物大分子进行特异性的化学修饰。
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    成果

    从事复杂天然产物小分子的有机合成和化学生物学研究,攻克了一系列常规模式下合成挑战性很大的目标分子,包括目前已经临床使用的药物、以及重要的工具化合物,还开展了多种化合物的活性测试和机制研究,为新的工具分子和药物先导化合物的开发奠定了良好基础。已在JACS, Angew, PNAS, Cell Res. 等国际重要学术期刊发表论文42 篇,拥有4 项授权专利和2 项专利申请。

     


    荣誉

    • 自然科学基金委优秀青年科学基金

    • 2019 第七届中国化学会- 英国皇家化学会青年化学奖

     

    代表论文

    1. Chen, H.; Li, Z.; Shao, P.; Yuan, H.; Chen, S.-C.; Luo, T.* Total Synthesis of (+)-Mutilin: A Transannular [2+2] Cycloaddition/Fragmentation Approach. J. Am. Chem. Soc. 2022144, 15462−15467.

    2. Kong, L.; Yu, H.; Deng, M.; Wu, F.; Jiang, Z.; Luo, T.* Enantioselective Total Syntheses of Grayanane Diterpenoids: (–)-Grayanotoxin III, (+)-Principinol E, and (–)-Rhodomollein XX. J. Am. Chem. Soc. 2022144, 5268−5273.

    3. Fang, X.; Zhang, N.; Chen, S.-C.; Luo, T.* Scalable Total Synthesis of (–)-Triptonide: Serendipitous Discovery of a Visible-Light-Promoted Olefin Coupling Initiated by Metal-Catalyzed Hydrogen Atom Transfer (MHAT). J. Am. Chem. Soc. 2022144, 2218−2224.

    4. Chen, S.-C.; Zhu, Q.; Cao, Y.; Li, C.; Guo, Y.; Kong, L.; Che, J.; Guo, Z.; Chen, H.; Zhang, N.; Fang, X.; Lu, J.-T.; Luo, T.* Dealkenylative Ni-Catalyzed Cross-Coupling Enabled by Tetrazine and Photoexcitation. J. Am. Chem. Soc. 2021143, 14046−14052.

    5. Cai, Y.#; Zhou, H.#; Zhu, Y.#; Sun, Q.; Ji, Y.; Xue, A.; Wang, Y.; Chen, W.; Yu, X.; Wang, L.; Chen, H.; Li, C.; Luo, T.*; Deng, H.* Elimination of Senescent Cells by β-Galactosidase-Targeted Prodrug Attenuates Inflammation and Restores Physical Function in Aged Mice. Cell Res. 202030, 574−589.

    6. Guo, Y.; Guo, Z.; Lu, J.-T.; Fang, R.; Chen, S.-C.; Luo, T.* Total Synthesis of (–)-Batrachotoxinin A: A Local-Desymmetrization Approach. J. Am. Chem. Soc. 2020142, 3675−3679.

    7. Kong, L.#; Su, F. #; Yu, H.; Jiang, Z.; Lu, Y.; Luo, T.* Total Synthesis of (–)-Oridonin: An Interrupted-Nazarov Approach. J. Am. Chem. Soc. 2019141, 20048−20052.

    8. Yu, X.; Xiao, L.; Wang, Z.; Luo, T.* Scalable Total Synthesis of (–)-Vinigrol. J. Am. Chem. Soc. 2019141, 3440−3443.

    9. Guo, Y. #; Quan, T. #; Lu, Y.; Luo, T.* Enantioselective Total Synthesis of (+)-Wortmannin. J. Am. Chem. Soc. 2017139, 6815−6818.

    10. Yu, X.; Su, F.; Liu, C.; Yuan, H.; Zhao, S.; Zhou, Z.; Quan, T.; Luo, T.* Enantioselective Total Syntheses of Various Amphilectane and Serrulatane Diterpenoids via Cope Rearrangements. J. Am. Chem. Soc. 2016138, 6261−6270.

     


  • 李毓龙 Yulong LI

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    李毓龙      Yulong LI




    分子生理学研究所

    合作研究员

    yulong@gmail.com



    Timeline

    • 2020 至今                 深圳湾实验室         合作研究员

    • 2012 至今                 北京大学生命科学学院         教授

    • 2006-2012               斯坦福大学         博士后

    • 2000-2006               杜克大学 神经科学         博士

    • 1996-2000               北京大学 生理及生物物理         学士

     

    研究领域

    李毓龙课题组致力于研究神经生物学领域的前沿科学问题,研究工作主要包括以下几个方面:

    1.     开发可遗传编码的检测神经递质/调质、电突触的荧光探针

    2.     神经系统中“孤儿”G蛋白偶联受体研究

    3.     开发可用于在体及电镜体系神经系统连接组学标记的新方法

     

    代表论文

    1. Jing, M. *, Zhang, P. *, Wang, G., Feng, J., ... Zhu, JJ. # & Li, Y. # (2018). A genetically-encoded fluorescent acetylcholine indicator for in vitro and in vivo studies. Nature Biotechnology, 36(8), 726-737.

    2. Sun, F. *, Zeng, J. *, Jing, M. *, Zhou, J., Feng, J., ... & Li, Y. # (2018). A genetically-encoded fluorescent sensor enables rapid and specific detection of dopamine in flies, fish, and mice. Cell, 174(2), 481-496.

    3. Feng, J., Zhang, C., Lischinsky, JE., Jing, M., ... & Li, Y. # (2019). A Genetically Encoded Fluorescent Sensor for Rapid and Specific In Vivo Detection of Norepinephrine. Neuron, 102(4), 745-761

    4. Wu, L., Dong, A., Dong, L., Wang, S. Q., & Li, Y. # (2019). PARIS, an optogenetic method for functionally mapping gap junctions. eLife, 8, e43366

    5. Yu, H., Zhao, T., Liu, S., Wu, Q., Johnson, O., Wu, Z., Zhuang, Z., Shi, Y., He, R., Yang, Y., Sun, J., Wang, X., Xu, H., Zeng, Z., Lei, X., Luo, W.*, & Li, Y.* (2019). MRGPRX4 is a bile acid receptor for human cholestatic itch. eLife

     

    个人网页http://www.yulonglilab.org

  • 曾健智 Jianzhi ZENG

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    曾健智   Jianzhi ZENG

     


    分子生理学研究所

    启航学者

    zengjz@szbl.ac.cn

     

     

    Timeline

    • 2024 至今                深圳湾实验室                               启航学者

    • 2022-2024              深圳湾实验室                               博士后

    • 2021-2022              基石资本                                      分析员         

    • 2015-2021              北大-清华生命科学联合中心          博士

    • 2011-2015              湖南大学                                      学士

     

     

     

    研究领域
    曾健智实验室致力于开发神经影像工具,探究病理和生理过程中关键信号的分子动力学。

    1. 开发关键信号的可视化成像技术。

    2. 探究神经炎症反应的发生和干预机制。

    3. 探究学习记忆的神经环路和分子机制。

     

     

     

    研究成果

    1.“从0到1”参与开发多巴胺荧光探针,实现在活体果蝇、斑马鱼和小鼠中检测多巴胺在嗅觉感知、恐惧行为、学习记忆和社交行为中的分子动态(Cell,2018)。荣获“2018年中国生命科学十大科技进展”,并受到《人民日报》的科普报道。

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    2. 围绕巴甫洛夫式学习过程中“铃铛与食物”的有效时间间隔问题,揭示了五羟色胺参与调控学习记忆时间窗口的分子和神经环路机制(Neuron,2023)。受到《人民日报》的科普宣传。

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    荣誉

    2024  深圳市优秀博士后,深圳市博士后联谊会

    2023  “青年人才托举工程”,中国神经科学学会,中国科协

    2023  第十七届张锡钧基金全国青年优秀生理学学术三等奖, 中国生理学会

    2023  张香桐神经科学优秀研究生论文奖, 张香桐基金会,中国神经科学学会

    2021  吴瑞奖,吴瑞基金会

     

     

    媒体报道

    1. 启航学者 | 曾健智:手握光明,点亮大脑

    https://www.szbl.ac.cn/infomation/features/szblpeople/5487.html

    2. 【超深度】和北大脑科学博士聊聊情绪与激素 ft. 曾健智|TIANYU2FM - E093

    https://www.bilibili.com/video/BV1Wm411f7Ze/

    3. 神经递质光学探针|脑师说 当代神经科学技术 第1期

    https://www.bilibili.com/video/BV1Gu411j7mk/

    4. 揭开巴甫洛夫留下的百年之谜(新知) - 人民日报

    http://paper.people.com.cn/rmrb/html/2023-02/13/nw.D110000renmrb_20230213_3-19.htm

    5. 我国科学家开发出新型探针在神经科学领域取得重要突破

    http://ip.people.com.cn/n1/2018/0719/c417807-30156484.html

     

     

    代表论文

    1. Zeng, J.*#, Li, X.*, Zhangren, Z., ... & Li, Y.# (2023). Local 5-HT signal bi-directionally modulates the coincident time window of associative learning. Neuron. (*co-first author; #co-corresponding author)

    2. Zeng, J., Sun, F., Wan, J., Feng, J. & Li, Y.# (2019). New optical methods for detecting monoamine neuromodulators. Current Opinion in Biomedical Engineering.

    3. Sun, F.*, Zeng, J.*, Jing, M.*, Zhou, J., Feng, J., Owen, S., ... & Li, Y.# (2018).  A genetically-encoded fluorescent sensor enables rapid and specific detection of dopamine in flies, fish, and mice. Cell(*co-first author)

    Full publication list:

    https://scholar.google.com.hk/citations?user=c4lK_QoAAAAJ&hl=zh-CN